2026年9月17日

世界咖啡研究组织发布阿拉比卡SNP基因指纹库,覆盖23个常见品种

2023年10月2日
qj

世界咖啡研究组织(WCR)联合瑞典Intertek Agritech实验室,在拉丁美洲和非洲采集常见阿拉比卡品种样本,成功构建了基于SNP指纹的参考数据库。这一数据库目前涵盖23个品种,向公众免费开放,旨在解决咖啡行业因遗传测试成本高昂而长期存在的品种误认问题。通过简单的叶片采集和基因分型,生产商可以低成本验证咖啡树的遗传纯度,避免因品种不符导致的经济损失。WCR计划未来持续扩充品种数量,推动咖啡供应链的品种识别与保护。

2021年至2023年期间,世界咖啡研究组织(WCR)在拉丁美洲与非洲多地采集了常见阿拉比卡咖啡品种的样本,并携手瑞典Intertek Agritech实验室完成基因分型工作,从而构建了样本的SNP指纹图谱,并开发出一套参考数据库。

什么是SNP标记?

SNP(单核苷酸多样性)属于一种分子遗传标记,是分析植物品系遗传变异的关键手段。这些细微的变异如同散布在植物DNA序列中的一串标记,能够用来构建某个品种的遗传“指纹”。

世界咖啡研究组织发布阿拉比卡SNP基因指纹库,覆盖23个常见品种

采集咖啡叶片样本用于遗传分析

如何利用SNP检测咖啡的遗传特性

倘若生产商希望核查咖啡树的遗传纯度,以确认自己种植的正是目标品种,只需从待鉴定的咖啡树上摘取一片小叶,送至基因分型实验室。实验室会从叶片中提取DNA,读取SNP图谱,随后将样本的SNP指纹与相关品种的已知指纹进行比对,一旦指纹吻合,便能确认品种身份。

WCR指出:当前植物遗传测试因费用高昂、成本不菲,尚无法在咖啡行业大规模推广,而品种验证的缺失可能导致某些商业咖啡品种被生产商或下游供应链参与者错误识别。此前一项关于“遗传整合”的研究发现,在88个待鉴定是否为瑰夏品种的咖啡样本实验中,仅有61%的咖啡树在遗传上保持一致(这意味着39%的样本不符合该品种的预期遗传图谱)。这种“遗传不一致”可能给农民带来灾难性的经济后果,例如农民可能种植了一种所谓的抗病品种,但最终它在遗传上并不一致,反而更容易感染病害。

开发低成本、快速的基因分型工具,有助于全球咖啡供应链参与者识别和追踪生产过程中的咖啡品种。因此,该数据库最重要的应用方向之一便是开发低成本的品种认证。目前数据库涵盖23个常见品种,无限制向公众开放。WCR计划在未来数月乃至数年内增添更多品种的SNP指纹。

数据库收录的咖啡品种

世界咖啡研究组织发布阿拉比卡SNP基因指纹库,覆盖23个常见品种

该数据库能够帮助咖啡行业相关人士更有效地识别和保护不同品种的阿拉比卡咖啡豆,并为咖啡鉴定人员提供准确的参考资料。咖啡供应商和研究机构可通过该数据库进行低成本、高质量的基因分型,用于育种和种子质量控制;种子供应商和育苗场则能为咖农提供足够数量且基因纯正、健康的幼苗。这将增加咖农获得改良且适应性强的品种的机会,进而提高产量与利润。

免责声明:本文部分图片来源网络,网站部分内容如图片、我们会尊重原作版权注明出处,但因数量庞大,会有个别图文未来得及注明,请见谅。若原作者有任何争议均可与网站联系处理,一旦核实我们将立即纠正,由“咖评 vdailycom ”整理编辑,转载请注明,本文意在传播咖啡文化,若侵权请告知删除,谢谢~!

以上内容由咖啡资讯网站 CoffeeHunters 编译.

你可能也喜欢